与传统药物相比，多肽药物具有以下明显的优势：

(1) 活性高，在很低的剂量和浓度下即可表现出显著的高活性；

(2) 分子量小，相对蛋白质而言易于人工化学合成，方便进行结构改造；

(3) 合成效率高。近年来技术的进步使多肽的固相合成变得简单，过程自动化，易于控制；

(4) 副作用小。由于许多多肽药物采用与人同源的序列，加之分子量小，无抗原性，不易引起免疫反应。