朱镕基同志主持工作时期，正值我国从计划经济转向社会主义市场经济的关键阶段，推动多项基础性改革，搭建起市场经济体制基本框架，核心改革归纳如下 ：

1. 分税制财税改革
改变过去地方财政包干模式，理顺中央与地方财权事权，中央财政实力得到增强，建立起适应市场经济的财税框架，同时推进税制统一，公平各类市场主体税负 。
2. 金融体制改革
把人民银行转型为真正的中央银行，剥离国有银行政策性业务，组建政策性银行，推动国有专业银行向商业银行转型；完成汇率并轨，实行有管理的浮动汇率；设立四大资产管理公司处置银行巨额不良贷款，筑牢金融风险防线 。
3. 国企改革攻坚
推行“抓大放小”，大型国企建立现代企业制度，推进股份制改制上市；放开搞活中小型国企；落实国企三年脱困目标，实行债转股，让企业走向优胜劣汰的市场机制，结束计划时代政企不分的模式 。同步配套建立下岗职工基本生活保障、失业保险、城市低保，搭建初步社会保障网，应对改革带来的社会阵痛 。
4. 价格与流通改革
大幅放开各类商品计划定价，绝大多数商品交由市场供求决定价格，告别计划经济的指令定价，市场开始成为资源配置的主要力量 。
5. 政府机构改革
大规模精简政府机构，削减计划经济时代的行业管理部门，推动政企分开，政府从直接管企业，转向宏观调控、市场监管，适配市场经济治理模式 。
6. 住房制度改革
结束福利分房制度，推动住房商品化，房地产市场逐步形成。
7. 扩大对外开放，加入WTO
主持艰苦谈判，推动2001年我国加入世界贸易组织，倒逼国内各项制度对标国际市场规则，全面融入全球市场经济体系 。

此外，他还有效治理通胀实现经济软着陆，沉着应对亚洲金融危机冲击，在改革过程中兼顾发展与风险防控，为后续市场经济发展打下制度基础 。